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培训课程

LAMMPS分子动力学培训课程

 分子动力学模拟是近年来飞速发展的一种分子模拟方法,已经被广泛应用于化学化工、材料科学与工程、物理、生物医药等科学和技术领域,起到越来越重要的作用。LAMMPS是分子动力学领域应用的著名软件,其力场丰富、计算效率高,被广泛采用。北京泰科博思科技有限公司联合苏州大学,将于2016年5月14日~17日在苏州举办“LAMMPS分子动力学培训课程”。

 本次课程特邀了有着丰富LAMMPS使用和应用经验的张存老师担任主讲教师,就分子动力学理论基础、LAMMPS运行方法、结果分析等方面进行了全面详致地讲解,并辅以丰富的应用实例;同时还邀请苏州大学的王衍伟老师,他将结合多年研究经验,以“高分子体系的全原子与粗粒化分子动力学模拟”为主题,详解其相关理论及应用。本次培训班还将提供LAMMPS软件的图形界面:MAPS-LAMMPS试用版,并在培训期间举办该图形界面的免费培训讲座和答疑。  

 

培训时间

2016514日~17 9:0017:00

培训地点

苏州大学独墅湖校区(具体教室第二轮通知公布)  

培训费用

2000/人,含午餐(其它餐费、住宿费及交通费自理)

56日之前报名缴费8折优惠(1600/人)

培训内容

一、分子动力学模拟

1. 分子模拟简介

2. 分子力学、分子动力学计算原理及方法

3. 常见系综简介(控温、控压方法)

4. 全原子力场及粗粒化方法

5. 分子动力学软件简介

 

二、LAMMPS简介

1. LAMMPS命令及文档

2. LAMMPS例解(in文件及data文件)

1)初始构型文件分析

2)系综及约束条件

3)数据输出及前后处理

 

三、LAMMPS编译、安装及运行

1. 不同平台下的编译及安装

2. VMD基本操作及高级应用

3. Linux相关命令及工具

4. 超算任务提交及处理 

 

四、 LAMMPS功能扩展及接口

1. LAMMPS代码构架及修改

2. Python接口

 

五、综合案例讨论及实践

工程实例1:石墨烯弯曲能的计算

工程实例2:金属表面能计算

工程实例3:可控手性碳纳米管自组织制备的数值模拟

 

六、针对高分子体系的全原子与粗粒化分子动力学模拟

理论部分: 针对高分子体系的全原子与粗粒化分子动力学模拟的发展现状及研究

应用实例1: 聚乙烯熔融体的建模与分子动力模拟

应用实例2: 聚乙二醇分子在溶液中的构象模拟

应用实例3: 粗粒化珠-簧链模型的建模及溶液构象的Langevin动力学模拟

应用实例4: 模拟粗粒化珠-簧链在模型表面的吸附行为

应用实例5: 空间受限及拥挤环境下的高分子链的构象模拟

 

*具体时间安排见第二轮通知

温馨提示:因有实例操作内容,请自带笔记本电脑。

 

报名方式

请填写培训课程报名表,编辑邮件标题:LAMMPS培训,并连同报名表发送到info@tech-box.com.cn

报名表下载请点击这里

* 注:本次培训班控制人数在30 人,以报名先后顺序为准。

 

联系方式

联系人:苗月

座机:010-51651689-309

手机:13552957826Emailmiaoyue@tech-box.com.cn

付款信息

电汇截止日期2016510日。凭汇款单在签到时领取发票(发票项目:会议费),请在回执中填写正确的发票单位名称。

收款单位全称:北京大德博智科技有限公司

开户行名称:中国民生银行北京亚运村支行

账号:691537056

* 注:汇款时请注明:学校名称+ 主要联系人

讲师介绍

1. 张存

理学博士。20151月毕业于中国科学院力学研究所。目前研究方向是微纳米力学及表界面力学,主要通过理论建模和分子模拟等手段研究碳基纳米材料及金属纳米材料的物理性质及自组装特性,相关研究成果发表在Nano ResearchJPCCComputational Materials Science等国际学术期刊上。

 

2. 王衍伟

苏州大学材料与化学化工学部副教授,研究领域为大分子体系理论计算与模拟。2003年毕业于浙江大学化工系,先后留学日本、丹麦和美国,2009年于丹麦技术大学获得博士学位。2008.9 - 2011.8期间在丹麦技术大学和美国明尼苏达大学从事博士后研究工作,2011.9月起加入苏州大学材化部高分子科学与工程系。长期从事聚合物和生物大分子体系理论计算与模拟工作,涉及的研究对象包括高分子溶液构象和动力学行为、体积排除色谱分离机理、半刚性高分子链、拓扑结构高分子、DNA在微纳米通道中的物理行为、蛋白质-高分子偶联物以及聚电解质等,使用的计算模拟方法主要为蒙特卡洛方法、分子动力学和介观尺度动力学模拟,曾在J. Chem. Phys., Macromolecules, PRL,Biomicrofluidics等刊物上发表论文数十篇。在苏州大学讲授“分子模拟入门”(http://kczx.suda.edu.cn/mdmc.html)、“高分子物理”和“化工原理” (http://kczx.suda.edu.cn/nana2013.html) 等课程,有丰富的教学经验。

 

3.  宏 博士 北京泰科科技技术总监

本科毕业于清华大学,2005年在中国科学院金属研究所获得博士学位。从事分子模拟技术支持工作11年,为全国300多个工作组及国家级计算中心提供过多种分子模拟软件的安装、调试及使用培训服务, 并与多家课题组联合开展过材料、化工等多领域的科研合作工作。