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材料及化工

BIOVIA Discovery Studio 药物设计软件平台

  BIOVIA Discovery Studio

  BIOVIA Discovery Studio的开发基于BIOVIA PipelinePilot,是功能全面的科学应用软件。软件兼具有开放性、可量化性、协作性,是面向当今生命科学研究需求而开发的独特的研究工具。

  · 全面的科研软件包

  - 面向科研需求,为从早期研发至临床前期、生物制药配方开发提供了科学的解决方案

  · 成熟的科学原理

  - 拥有30多年的同行评审研究成果为Discovery Studio的科学核心提供支撑

  · 协作研究

  - 基于DS Visualizer,Discovery Studio为研发提供了真正全面的可视化及协作框架

  · Discovery Studio:基于Pipeline Pilot应用

  - Discovery Studio的每个任务皆基于Pipeline Pilot协议,以确保建模与模拟环境的开放性

  - 可对研究进行自定义及扩展

  - 可扩展架构

  - 可部署的工作流程

  - 为创新提供支持

  - 可与第三方应用集成,包括CCDC GOLD*及伊利诺伊大学厄巴纳-香槟分校的NAMD?

  - Discovery Studio拥有Pipeline Pilot下述组件的分许可:Core、Integration、Reporting、Chemistry、Sequence Analysis、ADMET

  功能全面的科学预测软件

  · 模拟:

  - 基于BIOVIA CHARMm力场引擎,可为单点能、小化、分子动力学模拟及自由能计算提供最佳的模拟结果

  - 基于从头算DFT量子力学的DMol3、半经验(VAMP)及QM/MM杂化算法(DMol3/CHARMm

  · 大分子设计与分析:

  - 市场领先的同源模型算法MODELER

  - 基于pH值的最佳蛋白质电离工具

  - 基于pH值的蛋白质稳定性及亲和力突变的独特分析

  - 使用ZDOCK对蛋白质-蛋白质对接进行可靠预测

  · 抗体研发

  - 功能完善的针对抗体研究的结构预测及模拟工具

  - 成熟自动化结构预测工作流,用于开发寻找最佳抗体的同源模型

  - 独家专利的AggMap蛋白质聚集及Developability Index

  - 快速鉴定生物药剂蛋白质翻译后修饰(PTM)相关的模体序列

  · 基于结构的设计(SBD

  - 基于物理性质(CHARMm CDOCKER)的独特对接引擎

  - 包括对期望的、不期望的及不符合相互作用类型的独有的非键分析检测

  - 基于MMP的独特的活性悬崖检查

  · 基于片段的设计(FBD

  - 利用经典药物化学反应进行原位枚举,利用ca.10k从BIOVIA ACD预筛选试剂

  - 使用ca.来自BIOVIA SCD的150万种商用化合物支架跳跃

  - 独特的KarplusMCSS(多拷贝同时搜寻法)片段对接引擎

  · 基于药效团及配体的设计:

  - 市场领先的CATALYST药效团引擎

  - 生成独特的受体-配体药效团

  - 最大的经过验证的配体分析数据库PharmaDB

  · QSAR、ADMET及TOPKAT预测毒理学

  - QSAR:可计算物化性质、拓扑指纹性质并生成PLS、GFA、MLR等

  - 全面的ADMET及预测毒理学模型,包括脑血屏障渗透、肝毒性、CYP2D6、AMES、大鼠经口半数致死剂量等

  · X-射线

  - 利用CNX生成电子密度图、图片精修,及利用HT-X PIPE对蛋白质-配体络合物进行自动结构测定